Entre 2016 e 2018, a equipe da Biota acompanhou e monitorou as medidas impostas pelo acordo assinado entre as partes no caso do Rompimento da Barragem de Fundão, em Mariana (MG). A Consultoria atuou na vice-presidência do Comitê Interfederativo (CIF) e na coordenação da Câmara Técnica de Restauração Florestal e Produção de Água, responsável, entre outros, pelo Programa de Recuperação de Nascentes do rio Doce.
Em 2019, a equipe Biota passou a assessorar o Ministério Público Federal no caso, até 2021. Nesse período, contribuiu para o processo de repactuação do Termo de Transação e Ajuste de Conduta (TTAC)
entre a União, os Estados de MG e ES e a Samarco/Vale/BHP.
O trabalho envolveu tanto assessoramento técnico quanto recomendações para reparação dos danos do desastre de Mariana, contemplando as necessidades das populações afetadas, a recuperação da
biodiversidade e os conflitos inerentes à negociação entre as partes interessadas.